La série nous fait suivre trois docteurs. Le premier, c'est le docteur John Dorian, alias J.D., qui a choisi la médecine générale. Le deuxième, c'est son vieil ami d'enfance, Chris Turk, qui s'est tourné vers la chirurgie. Pour finir, il y a le Docteur Elliott Reid, une jeune femme séduisante mais assez maladroite, qui ne laisse pas J.D. indifférent ... Turk est, lui, plutôt attiré par l'infirmière Carla Espinosa. Ces trois jeunes docteurs vont donc découvrir le milieu hospitalier et ses difficultés. Ils sont dirigés par les docteurs Kelso et Cox, qui n'hésitent pas à se moquer d'eux et à les bousculer !